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【噬纪家园】柳叶刀子刊:“病毒组体检”来了：噬菌体一变，肠道就出问题；Cell:细菌也会搞基建；反转录ssDNA信号激活细菌防御
日期：2026-03-25
01 行业进展
中山医院开设耐药菌专病门诊
提供噬菌体精准治疗新选择
近日，复旦大学附属中山医院感染性疾病科设立“耐药菌专病门诊”，面向复杂耐药菌感染患者，提供包括噬菌体疗法在内的精准个体化诊疗服务。该门诊由专业感染团队负责，实行全流程管理，涵盖精准诊断、个体化治疗及长期随访。诊疗范围包括由碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌、多重耐药鲍曼不动杆菌、甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌等引起的感染。作为国内率先将噬菌体治疗纳入临床体系的门诊之一，该中心致力于为耐药菌感染患者提供安全、高效的新型替代治疗途径。
（门诊时间：周三下午；地点：上海市徐汇区医学院路111号中山医院西院区20号楼2楼感染病科。）
原文链接
噬菌体新药BX011获FDA积极反馈
或为糖尿病足带来新疗法
近日，以色列-美国生物技术公司BiomX宣布，其噬菌体新药管线BX011获得美国食品药品监督管理局(FDA)积极反馈。FDA支持BX011进入生物制品许可申请(BLA)潜在通道，确认无需额外非临床研究，并认为其化学、生产与控制(CMC)方案符合现行质量标准。BX011是一种针对糖尿病足感染(DFI)中金黄色葡萄球菌的多噬菌体组合疗法，有望为抗生素耐药病例提供新方案。此前，BiomX旗下另一管线BX211在2期临床中已显示安全且可持续缩小溃疡面积，部分噬菌体也应用于BX011。若后续资金与临床顺利推进，BX011或成为糖尿病足感染治疗的新选择，并推动噬菌体疗法加速进入主流感染治疗领域。
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Cytophage完成私募融资
加速噬菌体疗法研发
近日，加拿大Cytophage Therapeutics宣布，其非承销私募融资将于11月10日完成首轮交割，如超额认购将延至11月17日。该轮融资计划发行约600万单位，总额约120万美元，并可增发至180万美元。募集资金将用于推进公司噬菌体治疗产品的临床开发及商业化进程。Cytophage致力于开发以噬菌体替代抗生素的感染治疗方案，本次融资完成后，公司资金实力将进一步增强，为后续临床阶段奠定基础。
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02 科研进展
No.1 Cell
Abdelaziz Heddi 团队
细菌自组装三维膜网络实现宿主碳源高效获取
近日，来自里昂国立应用科学学院(INSA Lyon)的Abdelaziz Heddi团队揭示，昆虫肠道共生细菌Sodalis pierantonius会主动构建复杂的三维膜性管状网络(tubenets)，以实现高效的碳水化合物摄取。
研究以谷象(Sitophilus oryzae)共生系统为模型，通过体积电子显微镜和同步辐射软X射线显微技术(STXM, Scanning Transmission X-ray Microscopy)发现，S. pierantonius在宿主细胞质中形成直径约20 nm、长度超200 nm的膜性tubenets，显著扩大了与宿主的物质交换界面。化学成分分析显示，这些tubenets富集碳水化合物，其谱图与葡萄糖高度吻合。基因组及转录分析进一步发现，糖转运蛋白基因(如PTS系统)和膜蛋白OmpC在tubenets中高表达，为碳源跨膜运输提供分子通路。该结构不同于传统细菌纳米管，体现了共生细菌在高代谢需求环境下的结构创新。研究为理解动物-微生物互利共生中的营养通道机制提供了重要结构基础，对揭示细胞内共生的进化适应具有重要意义。
doi: 10.1016/j.cell.2025.10.001.
No.2 Nat. Commun.
李锦铨 团队
构建口服噬菌体微球，实现肠道感染精准治疗
近日，来自华中农业大学的李锦铨教授团队构建了一种兼具保护与定向功能的新型噬菌体口服递送平台，实现了肠道病原菌的精准清除与共生菌群保护。研究团队利用电流体动力学雾化技术(electrohydrodynamic atomization)制备出双重响应型噬菌体水凝胶微球，包封效率达90%。该系统采用海藻酸钠和透明质酸钠等经FDA认证的GRAS材料(Generally Recognized As Safe)，在胃酸环境中保持稳定，仅于肠道条件下降解并释放噬菌体，有效避免其在胃内灭活。小鼠沙门氏菌感染模型实验表明，噬菌体微球可使病原菌负荷下降近2000倍，疗效与抗生素环丙沙星相当，却不破坏肠道菌群结构。与传统抗生素相比，该平台实现了“精准杀菌、生态友好”的双重突破。该研究为噬菌体疗法临床转化提供了关键技术路径，并为后抗生素时代的微生态精准干预开辟了新方向。
doi: 10.1038/s41467-025-65498-1.
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No.3 bioRxiv
Seth L. Shipman 团队
Ⅵ型反转录元通过msDNA信号解除抗病毒蛋白翻译抑制
近日，来自美国加州大学旧金山分校(UCSF)及Gladstone生物数据与生物技术研究所的Seth L. Shipman团队揭示了一种非典型细菌免疫调控机制。研究聚焦于副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)的Ⅵ型反转录元(retron)系统Retron-Vpa2，发现其在未检测到多拷贝单链DNA(msDNA, multicopy single-stranded DNA)的情况下，仍可对多种噬菌体产生广谱防御。
进一步研究显示，噬菌体感染可诱导Retron-Vpa2合成大量msDNA，该分子作为信号解除细菌自身抗病毒毒性蛋白(antiviral toxin)的翻译抑制，从而启动防御反应。研究还鉴定出一种独特的杂合RNA(hyRNA, hybrid RNA)，同时包含反转录模板与毒性蛋白编码序列，其结构变化在防御激活中起关键作用。该发现揭示了反转录元系统在细菌免疫中的多层级调控模式，为理解反转录相关防御机制提供了新框架。
doi: https://doi.org/10.1101/2025.10.22.683967
No.4 Lancet Microbe.
Britt Koskella 团队
“病毒晴雨表”：噬菌体变化预示肠道健康失衡
近日，来自加州大学伯克利分校Britt Koskella团队的研究系统回顾并整合了74项人类与动物微生物组研究，评估噬菌体是否可作为反映肠道等身体部位微生态健康的指标。
结果显示，在生态失调(dysbiosis)状态下，病毒群落的组成结构变化(β多样性, beta diversity)比数量多样性变化(α多样性, alpha diversity)更为敏感和一致：69%的研究报告β多样性显著改变，而仅41%的研究观察到α多样性显著变化。进一步定量分析表明，在健康状态下，细菌与噬菌体的α多样性呈中等正相关(r²=0.380，95%置信区间0.597–0.163)，而在生态失调状态下显著减弱(r²=0.118，p=4.9×10⁻¹⁰)，提示宿主微生态平衡被破坏。研究认为，细菌与噬菌体多样性关系的“断裂”可作为跨疾病系统的广谱生态失调标志，为肠道健康评估、疾病早期诊断及微生态干预提供新的生态学依据。
doi: 10.1016/j.lanmic.2025.101196.
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